对于太空育种未来发展前景，应重点选择用于西部开发的生态恢复的植物。因为支援西北地区，要有大量饲草、固沙的草本植物和灌木、抗寒和抗旱的树种，同时还要搭载能源植物和中草药。蔬菜要选择精品蔬菜种子搭载。花卉主要是搭载试管苗和高附加值的花卉。林木方面，神舟4号飞船搭载了美国红栌、杨树和红豆杉3种经济树种，今后我国还应继续搭载林木树种，同时还应从俄罗斯引进经过和平号空间站搭载的树种。 　　

　　种子产生突变后的效果主要和在太空中接受辐射的剂量多少、时间长短和所处的位置有关，和本身是什么种子没有关系。 　　

　　从太空回来的种子经过培育，挑选出的优良品种要经过不少于4代的种植，其中的每一代遗传性状都有所分离。如果4代后有幸筛选出一个新品种，还需要国家有关部门的品种审定，这一过程至少需要3年，之后专家审定合格后才能拿到证书。 　　

　　客观地说，对于是否搭载木本花木种子的问题，林木遗传育种界的反响并不很迫切。原因是多方面的，其中最重要的是木本植物自身的特性。许多林木遗传育种专家认为，由于1、2 a生植物的种子对外界刺激比多年生木本植物更敏感。林木生长周期长并凝聚着很高的生物量，使林木遗传育种的研究与农作物相比要困难得多。

　　诱变育种在草本花卉育种中也有很大价值，诱变后可使花卉变得奇形怪状，提高花卉的观赏价值。而林木育种则不同，人们对林木的期待，更多的是对数量性状的要求，特别是生长量的要求，而这是由数量基因控制的。根据微效多基因假说，林木的数量基因是众多的，其中某个或某几个基因的改变对提高林木数量性状的效益并不显著。专家所做的大量试验已证明了这一点，这可能正是长期以来，林木遗传育种专家并不看好搭载林木种子的原因之一。