生产上使用的微生态制剂主要有EM菌、益生素、促菌生、调痢生、制菌灵、止痢灵、抗痢灵、抗痢宝及乳霉生等。
　　（一）微生态制剂的选用原则在养猪生产中，微生态制剂的选用要遵循以下几个原则。
　　1.根据使用目的选择。微生态制剂不是万能的，根据用途不同，大体可以分为环境调节剂、病原控制剂、健康增进剂等三类。实际生产中，应根据不同的需要选择合适的制剂，如为预防疾病，应选择用乳酸菌、乳酸片球菌、双歧杆菌等产乳酸类细菌制成的微生态制剂；为促进生长、提高饲料利用率，可选择用芽孢杆菌、乳酸杆菌、酵母菌和霉菌等制成的微生态制剂；为改善养殖环境，应选择用光合细菌、硝化细菌及芽胞杆菌制成的微生态制剂。
　　2.根据饲喂对象选择。动物消化道內的微生物具有多样性和特异性，而不同种类的微生态制剂所含细菌对宿主又有一定的特异性。因此，选择微生态制剂时，一定要充分了解制剂菌种的性能类型和作用特点，从中选择最适合养猪业使用的制剂，不要盲目选购和使用。
　　3.根据控制目标选择。微生态制剂具有很强的针对性，生产上应根据不同的控制目标选用不同的活菌制剂。如：为防治1～7日齡仔猪腹泻，应首选以植物乳酸菌、乳酸片球菌及粪链球菌等产酸细菌制成的微生态制剂；为促进仔猪生长发育、提高日增重和饲料报酬，应选用以双歧杆菌等菌株制成的微生态制剂。
　　（二）微生态制剂的使用方法目前，微生态制剂已被公认为有希望取代抗生素的饲料添加剂，是发展绿色养殖业的重要保证，但使用方法必须科学合理，才能发挥出其应有的作用，否则，可能只会增加成本。
　　1.保存科学，配伍合理。微生态制剂属于活菌制剂，若保存方法不适、保存条件不当，都会造成细菌失活，因此必須根据其要求进行保存。一般应保存在干燥、阴暗的地方，适宜的保存温度为5～15℃，但应注意其保质期。已经开启但未用完的微生态制剂，应在保持干燥、阴暗的同时，加强密封管理，因为氧气可使其中的厌氧菌失活。
　　活菌制剂对抗生素及其他抑菌、杀菌药物都很敏感，因此，使用微生态制剂时，一般不要与抗生素及其他抑菌、杀菌药物混合使用，如果病情确实需要使用这些药物，也应间隔24小时以上再使用。一般是先用抗菌性药物清理肠道，为益生菌的定植和繁殖清除障碍，然后再服用微生态制剂，这样就可以达到较好的使用效果。
　　2.时机合适，剂量足够。在刚出生的仔猪体內，微生态平衡尚未建立，抵抗疾病的能力较弱，此时通过投喂微生态制剂引入益生菌，可较快占据附着点，尽快形成优势菌群，从而起到预防疾病、卫生保健的效果。在断奶、分群、长途运输、饲料更换、天气突变等应激条件下，猪体內微生态平衡常遭到破坏，若提前使用微生态制剂，对形成优势菌群也极为有利。根据试验，只有中低剂量的益生菌可以有效增加仔猪的日增重、日采食量，明显提高饲料转化率，而高剂量的益生菌反而影响仔猪的生长。在仔猪饲料中加入微生态制剂，每克饲料含菌量应达到（2～5）×106个；育肥猪每克饲料应含106个芽胞杆菌，乳酸杆菌制剂含菌量一般不少于107个/克，每日应投喂0.1～3克。
　　3.尽早使用，持之以恒。微生态制剂的作用机理，是通过有益微生物大量繁殖，竞争性地抑制有害细菌的生长，同时还能刺激机体提高免疫力，从而起到防治猪病（尤其是胃肠道疾病）的作用，若发生疾病后再去使用微生态制剂，肯定不如使用抗生素效果明显。因此，在微生态制剂的使用过程中，要全面了解微生态制剂的作用机理和产品特性，正确对待作用效果：若是用于疾病控制，则应以预防为主，防治结合；若是用作饲料添加剂，则需确保其稳定性，掌握好剂量；若是用于改善环境，应尽早使用，持之以恒。